巴彦淖尔市博物馆主要职能:举办各类文物展,宣传展示巴彦淖尔市文物古迹和历史沿革,对巴彦淖尔市各族人民进行爱国主义教育,使博物馆成为巴彦淖尔市对外展示的窗口;举办巴彦淖市美术、书法及各种私人收藏展,活跃群众文化生活,向区内外展示推荐巴彦淖尔市文化艺术方面的优秀人才;在巴彦淖尔市范围内进行历史文物、民族文物、革命文物等方面的征集收藏,扩大馆藏文物;对巴彦淖尔市的各级文物保护单位及馆藏文物进行分类研究,通过发表学术论文,扩大巴彦淖尔市文物知名度,积极开展对外文化交流;积极组织青少年参观博物馆,使博物馆成为青少年的第二课堂;开展对巴彦淖尔市境内流散文物的调查摸底,鉴定和组织定级工作,促进巴彦淖尔市文物市场的合法运转。